Тема творчества Игоря Малышева - гармония человека и природы, которую он раскрывает, привлекая мистическое начало. Герои произведений - люди и персонажи славянского фольклора: лешие, водяные, черти и др. («Дом», «Лис»). Как говорил сам писатель: «Мне хотелось быть уверенным, что кому-то на Земле хорошо, и я написал «Лиса». Герой одноименного романа Лис - бесенок, существо мистическое, но доброе. Это роман о любви к жизни, о необходимости ценить каждое прожитое мгновение, о том, как важно ценить и наслаждаться окружающим миром. Игорь Малышев пишет также и для взрослых. Подменыш - по народным поверьям, ребенок, подброшенный русалкой, лешим или иным лесным духом взамен похищенного человеческого дитя. Никто не знает, зачем они это делают и чего хотят достичь… Герои романа «Подменыши» - неформалы и нонконформисты, молодые люди, составляющие боевую группу, цель жизни которых - приблизить революцию в стране. Игорь Малышев придумал революционеров-романтиков, которые противостоят обществу потребления, борются с ним традиционным способом, используя оружие. В 2009 году роман «Подменыши» вошел в длинный список премии «Национальный бестселлер», получил премию журнала «Роман-газета» в номинации «Открытие года». В 2017 году автор представил свой новый роман о Гражданской войне «Номах. Искры большого пожара». Книга стала открытием года, номинировалась на премии «Русский Букер» и «Большая книга».